Au Togo, l’utilisation peu encadrée des antibiotiques dans les élevages de volailles favorise l’émergence de bactéries résistantes et expose les consommateurs à des risques sanitaires. C’est l’un des principaux constats d’une thèse de doctorat soutenue le 22 octobre 2026 par Bèlè Priscilla Tcheou. Ses travaux mettent notamment en évidence des insuffisances dans la réglementation des médicaments vétérinaires, les pratiques d’élevage et le contrôle de l’antibiorésistance.

Intitulée « Évaluation de l’antibiothérapie, des résidus d’antibiotiques et de l’antibiorésistance dans les élevages avicoles des régions Maritime et des Savanes au Togo : 2018-2024 », cette recherche s’inscrit dans une approche « Une seule santé » (One Health), qui prend en compte les liens entre santé animale, santé humaine et environnement.

L’étude révèle d’abord des failles dans le circuit de distribution des médicaments vétérinaires. Sur les 93 antibiotiques commercialisés recensés, 43,01 % ne disposaient pas d’une autorisation de mise sur le marché (AMM) dans l’espace UEMOA. La chercheuse a également identifié deux circuits de distribution : un circuit officiel et un circuit parallèle.

Entre 2018 et 2021, ses investigations ont permis de recenser huit grossistes importateurs et 49 points de distribution agréés. La pénicilline G, la tylosine et l’oxytétracycline figurent parmi les antibiotiques les plus importés.

« La sécurisation du circuit du médicament vétérinaire ne relève pas uniquement de la réglementation de l’élevage. C’est un véritable impératif de santé publique, car la qualité et le contrôle des antibiotiques utilisés dans les fermes ont des conséquences qui dépassent la santé des animaux », a souligné l’impétrante.

Des pratiques d’élevage préoccupantes

La recherche met en évidence des pratiques d’utilisation préoccupantes. Selon les résultats de l’enquête, 87 % des élevages étudiés fonctionnent sans encadrement vétérinaire. Le respect de la posologie n’est assuré que dans 47 % des cas. Les investigations révèlent également que des œufs sont commercialisés pendant le délai d’attente, période nécessaire après l’administration d’un médicament avant la consommation des produits issus des animaux traités.

Ces pratiques peuvent favoriser la présence de résidus d’antibiotiques dans les aliments. Les analyses réalisées avec le Premi®Test, un test qualitatif de détection, ont révélé des résultats positifs dans 49,4 % des échantillons d’œufs de pintades examinés dans les Savanes (43 sur 87), contre 38,5 % des échantillons d’œufs de poules pondeuses dans la région Maritime (25 sur 65).

Ces chiffres concernent uniquement les échantillons étudiés et ne permettent pas de généraliser les résultats à l’ensemble des œufs commercialisés au Togo.

L’antibiorésistance, une menace au-delà des élevages

L’un des apports importants de cette thèse concerne la caractérisation des bactéries résistantes aux antibiotiques. Sur 65 élevages étudiés dans la région Maritime, 45 ont présenté des bactéries résistantes, soit 69,23 %. Au total, 51 isolats bactériens ont été identifiés, notamment Escherichia coli, Proteus, Enterococcus faecalis et Enterococcus faecium.

Les antibiogrammes ont révélé des niveaux de résistance particulièrement élevés à certaines molécules. Chez Escherichia coli, le taux atteint 92,85 % pour la péfloxacine et 79 % pour la tobramycine. Chez Enterococcus faecium, la résistance à la moxifloxacine s’élève à 87,5 %.

Le séquençage de 20 souches bactériennes a également permis d’identifier plusieurs gènes associés à la résistance aux antibiotiques, dont qnrS1 et tet(A), retrouvés chacun dans 45 % des souches séquencées, ainsi que aac(6′) dans 40 % des cas. Des gènes de virulence ont aussi été détectés dans huit des douze souches concernées par cette analyse.

Plusieurs plasmides, des éléments génétiques susceptibles de faciliter la circulation des résistances entre bactéries, ont par ailleurs été identifiés. L’analyse d’un plasmide de type IncY a notamment révélé une forte similitude génétique avec un plasmide porté par une souche d‘Escherichia coli d’origine aviaire isolée en Finlande.

« Le problème ne s’arrête pas aux volailles. Les fientes peuvent contribuer à disséminer des bactéries résistantes et des gènes de résistance dans l’environnement, notamment lorsqu’elles sont utilisées comme fertilisants ou rejetées sans traitement adapté », explique la doctorante.

Ces résultats soulignent l’importance de la surveillance des résistances dans les secteurs animal, humain et environnemental. Ils ne démontrent toutefois pas une transmission directe de ces bactéries des élevages aux consommateurs, mais mettent en évidence des mécanismes susceptibles de favoriser leur circulation.

Renforcer la réglementation et la surveillance

Face à ces constats, Mme Tcheou recommande de renforcer le système national d’homologation des médicaments vétérinaires, de rendre effective l’obligation de prescription vétérinaire et d’assainir les circuits de distribution afin de lutter contre les produits commercialisés en dehors du circuit réglementaire.

Elle préconise également un programme national intégré de surveillance de l’antibiorésistance, associant les secteurs de la santé humaine, animale et environnementale. L’amélioration de la biosécurité dans les élevages, la vaccination, l’utilisation de probiotiques et le recours régulier aux professionnels vétérinaires figurent parmi les autres pistes avancées.

« Il faut agir simultanément sur la réglementation, les pratiques des éleveurs et la surveillance sanitaire. La prévention des maladies, le respect des prescriptions et le délai d’attente sont essentiels pour réduire le recours excessif aux antibiotiques et limiter la progression des résistances », insiste-t-elle.

Au terme de cette recherche, saluée pour son originalité et sa portée scientifique, le jury a décerné à Bèlè Priscilla Tcheou le grade de docteur avec la mention Très honorable et félicitations du jury. Ses travaux, valorisés par deux publications dans des revues scientifiques à comité de lecture, apportent des données importantes au débat sur la sécurité sanitaire des aliments et la lutte contre l’antibiorésistance au Togo.

La Rédaction